О проекте Напишите нам

Эксперимент ускоряется для проверки теоретической модели

« к списку статей

14.11.2013 Химический портал himsite.ru

В 1997 году, исследователи сообщили о том, что им удалось провести механическое растяжение мономолекулярной нити белка титина, установив при этом его первичную структуру.

Расчетные модели, применяющиеся для интерпретации результатов наблюдений изменений, протекающих на молекулярном уровне, смогли смоделировать это механическое воздействие только в рамках очень сжатой временной шкалы, и, чтобы свести эксперимент и теоретическую модель воедино, французские исследователи смогли ускорить эксперимент, значительно уменьшив время, необходимое для растяжения белка

Титин растягивали и прежде, но не настолько быстро как в новом эксперименте.

Титин – рекордсмен среди белков: он является самым большим одноцепочечным (не состоящим из отдельных субъединиц) белком, а также самым и самым гибким белком. Этот белок работает как пружина в мышечных волокнах, помогая вернуть мышцу в ее расслабленное состояние после сокращения.

В 1997 году несколько исследовательских групп использовали атомно-силовую микроскопию (АСМ) или лазерный пинцет, чтобы растянуть отдельные молекулы титина или ее фрагменты до состояния, в котором некоторые из его доменов не начали разрушаться. Проведенные эксперименты позволили определить, какое механическое воздействие надо оказать на титин, чтобы нарушить его третичную структуру, но не механизм этого развертывания. Чтобы разобраться, как полипептидная цепочка разворачивается, исследователям пришлось использовать компьютерное этого процесса.

Из-за ограничений в вычислительной мощности в то время моделирование могло охватывать периоды механического воздействия на титин, ограниченные пикосекундами. Это означает, что моделировалось гораздо более быстрое разворачивание (на несколько порядков быстрее), чем реальные эксперименты и результаты теоретического и экспериментального исследования могли не соответствовать друг другу.

Осуществив эксперимент со скоростью в 1000 раз большей, чем скорость экспериментов 1997 года, исследовательская группа Симона Шойринга (Simon Scheuring) сделала возможным осуществить сравнение результатов моделирования и эксперимента. В сравнении с обычной атомно-силовой спектроскопией, исследователи использовали кантилевер, который приблизительно в 30 раз короче (6 мкм), чем обычно используемые кантилеверы (200 мкм). Шойринг поясняет, что его исследовательская группа использовала новый образец подложки для того, чтобы минимизировать гидродинамическое сопротивление и очень быстрые электронные системы обработки эксперимента.

Германн Гауб (Hermann Gaub) из Мюнхенского университета им. Людвига Максимилиана, чья исследовательская группа была среди тех, кто доложил о механически инициированном разворачивании белка в 1997 году, одобрительно поприветствовал технический прогресс. Обращаясь к химическому мировому сообществу, Гауб отмечает, что своим докладом лаборатория Шуринга вносит заметный вклад в улучшение приборно-измерительного оборудования для одиночной молекулы и открывает дверь к лучшему пониманию биомолекулярного механизма.

Поведение молекул, наблюдаемое в высокоскоростном эксперименте и при моделировании, сильно отличаются от процессов, которые происходят с молекулами при меньших скоростях растяжения. Шойринг делает вывод, что, по-видимому, при быстром растяжении молекула изменяет конформацию с настолько большой скоростью, что ей не хватает времени, чтобы диффундировать в пространство, потому что траектория реакции, которую задает быстрое механическое растяжение, преобладает над другими процессами, которые может испытывать белок.

Шойринг говорит, что аналогичный подход мог бы также быть полезным для фармацевтической науки при изучении взаимодействий лиганд/рецептор. Однако скептики предупреждают, что значение такой работы для практических целей представляется затруднительным, поскольку механическое воздействие, которое прилагается к белку при его быстром растяжении, намного больше механического воздействия, которые белок может испытывать в своем естественном окружении.

Статья опубликована от компании: Химический портал himsite.ru

Ещё анонсы и статьи

17.06.2025 ООО «СМП Роботикс»

Мобильный робот Трал Патруль 7 – надёжная охрана любого объекта.

Мобильные роботы. Сегодня, многие предприятия стали заменять труд людей роботами. И это верное и выгодное решение. Мобильные роботы созданы для того, чтобы освободить человека от рутинной работы, выпо...

Читать далее »

23.05.2025 Ступинский химический завод

Ко Дню химика - Ступинский химический завод делится итогами работы

25 мая в России отмечают День химика – профессиональный праздник специалистов одной из ключевых отраслей промышленности. Один из лидеров отрасли бытовой химии подводит итоги работы. Ступинский хими...

Читать далее »

19.05.2025 Сейлс Солюшен

Инвестиции, обучение, экспорт: директор ЛМЗ делится опытом развития

В Молодёжном центре «Высота» состоялась дискуссия о мерах поддержки малого и среднего предпринимательства. В мероприятии приняли участие более 30 руководителей предприятий Лениногорского района. Ге...

Читать далее »

19.05.2025 Сейлс Солюшен

СейлсСолюшен на Нефтегаз 2025: надёжные решения по стандартам ASME для устойчивого развития отрасли

Компания СейлсСолюшен рассказала об итогах участия в международной выставке «Нефтегаз 2025», которая прошла в Москве с 14 по 17 апреля. Работа на одном из ключевых событий отрасли позволила укрепить д...

Читать далее »

23.04.2025 Химический портал himsite.ru

Оборудование для фасовки сыпучих продуктов в клапанные мешки: обзор и критерии выбора

Клапанные мешки — удобная тара для многих сыпучих продуктов. Цемент, сухие смеси, удобрения, корма... список длинный. Их особенность — специальный клапан для наполнения. Он сам закрывается под давлени...

Читать далее »

Copyright © 2009-2025 HimSite.ru - Портал химической промышленности, оборудование для химии, нефтехимии, полимеров.

Обратная связь